La moyenne du cycle Master n'est pas calculée par la somme des deux moyennes semestrielles/2, mais par la manière suivantes: 

[(moyenne de l'unité fondamentale S1 x coefficient de l'unité) + (moyenne de l'unité méthodologique S1 x coefficient de l'unité) + (moyenne de l'unité transversale S1 x coefficient de l'unité) + (moyenne de l'unité découverte S1 x coefficient de l'unité) + (moyenne de l'unité fondamentale S2 x coefficient de l'unité) + (moyenne de l'unité méthodologique S2 x coefficient de l'unité) + (moyenne de l'unité transversale S2 x coefficient de l'unité) + (moyenne de l'unité découverte S2 x coefficient de l'unité)]/somme des coefficients des unités de toute l'année.

Pour le M1, le résultat de la moyenne annuelle calculé par cette méthode est égal aussi à la somme des moyennes semestrielles divisée par 2, parce que les coefficients des unités entre le S1 et S2 sont équilibrés (les unités fondamentales des 2 semestres ont les mêmes coefficients et ainsi de suite). Par contre, dans le cas du M2 et selon le canevas ministériel, Le S4 contient uniquement 2 unités (mémoire (coefficient 10) et stage (coefficient 5), donc les coefficients des unités des semestres S3 et S4 ne sont pas du tout équilibrés et c'est pour ça que la moyenne annuelle est légèrement différente de la somme des moyennes semestrielles/2.